Mokyklos organizavimo darbas prasidėjo 1991 m. Iki 1993 m. buvo kuriamas teorinis ugdymo modelis. Veikla vyko 3 kryptimis: 1) siekiama sukaupti kuo daugiau metodinės ir vadybinės informacijos heterogeninių grupių ugdymo organizavimo klausimais; 2) tikrinama galimybė ir poreikis mokykloje diegti katalikišką ugdymą; 3) įstatymų nustatyta tvarka derinami mokyklos steigimo dokumentai LR Švietimo ir mokslo ministerijoje bei Vilniaus miesto savivaldybėje.
1993 m. grupė pedagogų, moksleivių tėvų ir Katalikų Bažnyčios autoritetų, pritariant ir remiant Vilniaus miesto savivaldybei, įsteigė Vilniaus darželį-mokyklą „Versmė“.
1997 m. darželis-mokykla „Versmė“ reorganizuotas į Vilniaus „Versmės“ vidurinę mokyklą.
2010 m. gegužės 19 d. mokykla tapo VšĮ Vilniaus katalikiškąja mokykla „Versmė“. Mokyklos steigėjai Vilniaus arkivyskupija ir Marijos Dangun Ėmimo seserų vienuolynas (asumcionistės).
2012 m. gegužės 14 d. akredituota Vilniaus katalikiškosios mokyklos „Versmė“ vidurinio ugdymo programa (valstybinis kodas 301001001).
2012 m. gegužės 15 d. mokykla tapo VšĮ Vilniaus „Versmės“ katalikiškąja gimnazija.

2017 m. rugsėjo 1 d. gimnazija tapo Palaimintojo Teofiliaus Matulionio gimnazija.

„Vis labiau ir labiau augo mintis apie mokyklą, kuri įrodys, kad neįgalūs vaikai gali gyventi šeimose ir mokytis kartu su savo kiemo vaikais, kurioje „sveikieji“ pažins fiziškai apribotą, bet sieloje laisvą  ir labai turtingą nuoširdumu, atvirumu ir troškimu gyventi pilnutinį gyvenimą vaiką. <…> Norėčiau, kad pirmoji tiesa, kurią vaikas sužinos, būtų: „Tu esi brangiausias toks, koks esi, nes esi dovana pasauliui“. (Alvyra Galkienė mokyklos „Versmė“ įkūrėja, iš knygos „Dovana“, 2020).

Pamokų laikas

1 pamoka: 8:00 – 8:45
2 pamoka: 8:55 – 9:40
3 pamoka: 9:50 – 10:35
4 pamoka: 10:45 – 11:30
5 pamoka: 11:40 – 12:25
6 pamoka: 12:35 – 13:20
7 pamoka: 13:25 – 14:10
8 pamoka: 14:15 – 15:00

Kalendorius

gruodžio

sausio 2021

vasario
P
A
T
K
P
Š
S
28
29
30
31
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
1
2
3
4
5
6
7
Events for sausio

1st

Events for sausio

2nd

No Events
Events for sausio

3rd

No Events
Events for sausio

4th

No Events
Events for sausio

5th

No Events
Events for sausio

6th

No Events
Events for sausio

7th

No Events
Events for sausio

8th

No Events
Events for sausio

9th

No Events
Events for sausio

10th

No Events
Events for sausio

11th

No Events
Events for sausio

12th

No Events
Events for sausio

13th

Events for sausio

14th

No Events
Events for sausio

15th

No Events
Events for sausio

16th

No Events
Events for sausio

17th

No Events
Events for sausio

18th

No Events
Events for sausio

19th

No Events
Events for sausio

20th

No Events
Events for sausio

21st

No Events
Events for sausio

22nd

No Events
Events for sausio

23rd

No Events
Events for sausio

24th

No Events
Events for sausio

25th

No Events
Events for sausio

26th

No Events
Events for sausio

27th

No Events
Events for sausio

28th

No Events
Events for sausio

29th

No Events
Events for sausio

30th

No Events
Events for sausio

31st