Mokyklos organizavimo darbas prasidėjo 1991 m. Iki 1993 m. buvo kuriamas teorinis ugdymo modelis. Veikla vyko 3 kryptimis: 1) siekiama sukaupti kuo daugiau metodinės ir vadybinės informacijos heterogeninių grupių ugdymo organizavimo klausimais; 2) tikrinama galimybė ir poreikis mokykloje diegti katalikišką ugdymą; 3) įstatymų nustatyta tvarka derinami mokyklos steigimo dokumentai LR Švietimo ir mokslo ministerijoje bei Vilniaus miesto savivaldybėje.
1993 m. grupė pedagogų, moksleivių tėvų ir Katalikų Bažnyčios autoritetų, pritariant ir remiant Vilniaus miesto savivaldybei, įsteigė Vilniaus darželį-mokyklą „Versmė“.
1997 m. darželis-mokykla „Versmė“ reorganizuotas į Vilniaus „Versmės“ vidurinę mokyklą.
2010 m. gegužės 19 d. mokykla tapo VšĮ Vilniaus katalikiškąja mokykla „Versmė“. Mokyklos steigėjai Vilniaus arkivyskupija ir Marijos Dangun Ėmimo seserų vienuolynas (asumcionistės).
2012 m. gegužės 14 d. akredituota Vilniaus katalikiškosios mokyklos „Versmė“ vidurinio ugdymo programa (valstybinis kodas 301001001).
2012 m. gegužės 15 d. mokykla tapo VšĮ Vilniaus „Versmės“ katalikiškąja gimnazija.

2017 m. rugsėjo 1 d. gimnazija tapo Palaimintojo Teofiliaus Matulionio gimnazija.

„Vis labiau ir labiau augo mintis apie mokyklą, kuri įrodys, kad neįgalūs vaikai gali gyventi šeimose ir mokytis kartu su savo kiemo vaikais, kurioje „sveikieji“ pažins fiziškai apribotą, bet sieloje laisvą  ir labai turtingą nuoširdumu, atvirumu ir troškimu gyventi pilnutinį gyvenimą vaiką. <…> Norėčiau, kad pirmoji tiesa, kurią vaikas sužinos, būtų: „Tu esi brangiausias toks, koks esi, nes esi dovana pasauliui“. (Alvyra Galkienė mokyklos „Versmė“ įkūrėja, iš knygos „Dovana“, 2020).

Pamokų laikas

1 pamoka: 8:00 – 8:45
2 pamoka: 8:55 – 9:40
3 pamoka: 9:50 – 10:35
4 pamoka: 10:45 – 11:30
5 pamoka: 11:40 – 12:25
6 pamoka: 12:35 – 13:20
7 pamoka: 13:25 – 14:10
8 pamoka: 14:15 – 15:00

Kalendorius

balandžio

gegužės 2021

birželio
P
A
T
K
P
Š
S
26
27
28
29
30
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
1
2
3
4
5
6
Events for balandžio

29th

Events for gegužės

1st

No Events
Events for gegužės

2nd

No Events
Events for gegužės

3rd

No Events
Events for gegužės

4th

No Events
Events for gegužės

5th

No Events
Events for gegužės

6th

No Events
Events for gegužės

7th

Events for gegužės

8th

No Events
Events for gegužės

9th

No Events
Events for gegužės

10th

No Events
Events for gegužės

11th

No Events
Events for gegužės

12th

No Events
Events for gegužės

13th

No Events
Events for gegužės

14th

Events for gegužės

15th

No Events
Events for gegužės

16th

No Events
Events for gegužės

17th

No Events
Events for gegužės

18th

No Events
Events for gegužės

19th

No Events
Events for gegužės

20th

Events for gegužės

21st

Events for gegužės

22nd

No Events
Events for gegužės

23rd

No Events
Events for gegužės

24th

No Events
Events for gegužės

25th

No Events
Events for gegužės

26th

No Events
Events for gegužės

27th

No Events
Events for gegužės

28th

No Events
Events for gegužės

29th

No Events
Events for gegužės

30th

No Events
Events for gegužės

31st

No Events
Events for birželio

1st

Events for birželio

3rd